MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 5904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	T	6	6	1501	1506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014738	A	7	7	3579	3585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014738	CTT	2	6	3605	3610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014738	A	6	6	3613	3618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014738	TAT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014738	A	8	8	4155	4162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014738	TTA	2	6	4175	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014738	T	7	7	4202	4208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014738	T	6	6	10712	10717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014738	TAT	2	6	11595	11600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014738	A	6	6	11601	11606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014738	A	6	6	12800	12805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014738	TAA	2	6	12845	12850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014738	A	7	7	12857	12863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014738	TCATT	2	10	12864	12873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014738	TAAA	2	8	13667	13674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014738	ACA	2	6	15082	15087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014738	ATA	2	6	15090	15095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014738	T	6	6	15112	15117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014738	GA	3	6	15606	15611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014738	AAT	2	6	15631	15636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014738	A	7	7	15641	15647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014738	A	6	6	15673	15678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014738	TTAA	2	8	15789	15796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014738	ATA	2	6	16323	16328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014738	T	7	7	16407	16413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014738	A	6	6	16466	16471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014738	TAG	2	6	17040	17045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014738	A	6	6	17053	17058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014738	TA	3	6	18963	18968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014738	T	7	7	19006	19012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014738	AAAAT	2	10	20404	20413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014738	ATT	2	6	21403	21408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014738	AGA	2	6	22334	22339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014738	T	9	9	22351	22359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014738	AGA	2	6	22369	22374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014738	TAAA	2	8	22404	22411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014738	GA	3	6	22431	22436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014738	TTTGT	2	10	22442	22451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014738	AGT	2	6	22479	22484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014738	ATT	2	6	22487	22492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014738	AT	3	6	22499	22504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014738	TAAA	2	8	22535	22542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014738	T	7	7	22549	22555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014738	ATA	2	6	22556	22561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014738	TAA	2	6	22570	22575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014738	ACA	2	6	26970	26975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014738	TA	3	6	26996	27001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014738	T	6	6	29192	29197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014738	TA	3	6	29245	29250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014738	T	6	6	29251	29256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014738	AG	4	8	29281	29288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014738	TAT	2	6	29317	29322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014738	A	6	6	29323	29328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014738	T	7	7	32574	32580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014738	GAT	2	6	32600	32605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014738	ATT	2	6	32610	32615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014738	T	7	7	32620	32626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014738	ATA	2	6	32637	32642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014738	TAA	2	6	33692	33697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014738	T	7	7	33708	33714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014738	TAA	2	6	33737	33742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014738	A	7	7	35105	35111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014738	A	7	7	35113	35119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014738	TCTT	3	12	35407	35418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014738	T	6	6	35437	35442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014738	A	6	6	35606	35611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014738	TGA	2	6	35629	35634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014738	AATCC	2	10	35732	35741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014738	TGC	2	6	35844	35849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014738	AGA	2	6	35975	35980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014738	CCAA	2	8	36046	36053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014738	AGA	2	6	36083	36088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014738	CTG	2	6	36090	36095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014738	ATAA	2	8	36109	36116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014738	T	6	6	36152	36157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014738	A	6	6	36162	36167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014738	ATT	2	6	37110	37115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014738	A	6	6	40110	40115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014738	CGT	2	6	40155	40160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014738	GTTTT	2	10	40175	40184	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014738	TAC	2	6	40199	40204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014738	A	6	6	40206	40211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014738	A	6	6	40247	40252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014738	TGT	2	6	41502	41507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014738	ATT	2	6	41534	41539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014738	TTA	2	6	41562	41567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014738	ATTT	2	8	41586	41593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014738	CTG	2	6	41655	41660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014738	GA	3	6	41669	41674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014738	ATC	2	6	41727	41732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014738	TAAA	2	8	41780	41787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014738	CT	3	6	41817	41822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014738	AAT	2	6	41868	41873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014738	TAA	2	6	41909	41914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014738	AT	3	6	41928	41933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014738	GAA	2	6	41983	41988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014738	T	7	7	42096	42102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014738	AG	4	8	42156	42163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014738	TGT	2	6	42196	42201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014738	TTCT	2	8	42211	42218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014738	A	6	6	42260	42265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014738	AATT	2	8	42907	42914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014738	AAT	2	6	42937	42942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014738	ATT	2	6	42972	42977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014738	TA	3	6	44519	44524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014738	ATGAA	2	10	44574	44583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014738	A	7	7	44582	44588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014738	GTT	2	6	44594	44599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014738	ATA	2	6	45544	45549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014738	TA	3	6	45572	45577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014738	ATT	2	6	45601	45606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014738	A	6	6	45661	45666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014738	ATG	2	6	45717	45722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014738	AGA	2	6	45779	45784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014738	AGT	2	6	45785	45790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014738	TATT	2	8	45831	45838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014738	TCTT	2	8	45849	45856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014738	TAT	2	6	45888	45893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014738	GAA	2	6	46014	46019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014738	AAGG	2	8	46030	46037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014738	AGAA	2	8	46260	46267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014738	AAAG	2	8	46346	46353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014738	AGAA	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014738	ACA	2	6	46418	46423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014738	ATT	2	6	46446	46451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014738	AAT	2	6	46517	46522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014738	GAT	2	6	46587	46592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014738	TACT	2	8	46620	46627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014738	ACA	2	6	46685	46690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014738	AG	3	6	46732	46737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014738	TTG	2	6	46742	46747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014738	TTTA	2	8	46799	46806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014738	TGT	2	6	46851	46856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014738	AAT	2	6	46918	46923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014738	AT	3	6	46930	46935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014738	GAAAT	2	10	46950	46959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014738	TAG	2	6	47005	47010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014738	AAG	2	6	47014	47019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014738	A	7	7	47021	47027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014738	AGT	2	6	47051	47056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014738	ACT	2	6	47106	47111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014738	TGT	2	6	47190	47195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014738	TAC	2	6	47217	47222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014738	CTA	2	6	47225	47230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014738	AGA	2	6	47328	47333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014738	AG	3	6	47337	47342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014738	GTT	2	6	47404	47409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014738	TAA	2	6	47444	47449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014738	ATG	2	6	47495	47500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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